Hiện nay, giao thông đường thủy nội địa trên địa bàn Tỉnh có 15 tuyến với tổng chiều dài 108,6 km, mật độ giao thông đường thủy nội địa chưa lớn, nhưng luồng lạch giao thông đường thủy khá phức tạp, có nhiều cửa sông ra biển và vùng đầm phá. Cấp kỹ thuật đường thủy nội địa trên địa bàn Tỉnh theo tiêu chuẩn TCVN 5664 : 2009 có 4 cấp (từ cấp III đến cấp VI), tương ứng với chiều dài trên các tuyến Sông Bồ, Sông Hữu Trạch, Sông Tả Trạch, Sông Truồi, Chợ mới - Hà Công, Vĩnh Tu - Quảng Lợi, Hải Dương - Tân Mỹ, Cự Lại - Quảng Xuyên, Tuyến I (Tuyến Phú Mỹ), Tuyến II (Tuyến Phú An), Đá Bạc - Tuý Vân, Đá Bạc - Vinh Giang, Vinh Hiền - Cầu Hai, Đá Bạc - Vinh Hưng, Truồi - Vinh Hưng.
Trên cơ sở Cấp kỹ thuật đường thủy nội địa vừa được công bố, UBND tỉnh yêu cầu các Sở, Ngành liên quan, UBND các huyện, thị xã và thành phố Huế tăng cường công tác quản lý, tuyên truyền, phổ biến và giáo dục pháp luật về giao thông thủy nội địa. Tiếp tục thực hiện chỉ thị số 18/CT-UBND ngày 26/5/2011 của UBND tỉnh về việc tăng cường công tác quản lý nhà nước đảm bảo trật tự, an toàn giao thông đường thủy nội địa trên địa bàn tỉnh.